Настройка среды для web разработки на Java в Windows

1. Установка JDK 
2. Установка Eclipse EE 
3. Импорт веб-проекта в Eclipse
4. Интеграция Eclipse с Apache Tomcat

Установка Java Development Kit (JDK)

Скачать последнюю версию JDK и установить, оставить все параметры по умолчанию.

Скачать
http://www.oracle.com/technetwork/java/javase/downloads/index.html
http://www.oracle.com/technetwork/java/javase/downloads/jdk7u7-downloads-1836413.html
http://download.oracle.com/otn-pub/java/jdk/7u7-b11/jdk-7u7-windows-i586.exe

Установка Eclipse Enterprise Edition

Скачать архив и разархивировать в рабочую папку(например в C:\Program Files\eclipse\), запустить eclipse.exe, настроить папку workspace.

http://eclipse.org/
http://www.eclipse.org/downloads/
http://www.eclipse.org/downloads/packages/release/indigo/sr2

Скачать
http://www.eclipse.org/downloads/download.php?file=/technology/epp/downloads/release/indigo/SR2/eclipse-jee-indigo-SR2-win32.zip

Импорт проекта в Eclipse

Скопировать папку проекта в рабочую папку eclipse (workspace) выбранную на предыдущем шаге. 
Выполнить команду File -> Import
Выбрать General -> Existing projects into Wirkspace
Выбрать папку проекта и импортировать проект.

Интеграция Eclipse с Apache Tomcat

Для публикации и отладки на сервере Tomcat ниобходимо добавить этот Сервер в Eclipse.
На панели Servers необходимо добавить или создать новый сервер
Выбрать тип сервера Apache Tomcat 6.0
Выбрать директрию в которую был установлен сервер Tomcat (C:\Program Files\Apache Software Foundation\Tomcat 6.0\) и создать сервер.
Добавить проект для публикации его на сервере.
Далее запустить сервер(перед этим необходимо остановить службу рабочего сервера на компьютере)Проверить работоспособность набрав адрес в браузере http://localhost:8080/<имя проекта>/Для отладки необходимо запускать сервер в режиме отладки.